SpongeBob SquarePants bereikt een emotioneel hoogtepunt wanneer hij eindelijk hoog genoeg is om in een achtbaan te gaan. Wanneer hij echter niet durft, besluit hij zijn moed te bewijzen aan Meneer Krabs door de Vliegende Hollander, een mysterieuze en roekeloze spookpiraat, te volgen. SpongeBob belandt al snel in een groots zeevaartavontuur wanneer hij de onderwereld bereikt.